В конце 60-х - начале 70-х годов на территории Вярска были открыты источники с минеральными водами. Минеральная вода получила название, одноименное с местностью Вярска. О лечебных пресноводных грязях было известно уже давно. Лечебная грязь зарождалась на протяжении нескольких веков в мелководном проливе под названием "Теплое озеро" ("Лямми"). Этот пролив соединяет Чудское озеро с Псковским, вдоль берега которого расположилась волость Вярска. В 1971 году постановлением правительства окрестности были признаны курортом местного значения, а в 1972 году было принято решение основать на территории Вярска санаторий. 3 мая 1980 года санаторий Вярска открыл первые лечебные корпуса.

В 2007 году на территории санатория Вярска открылся SPA - комплекс Водный центр. Он включает в себя отель, тренажерный зал, SPA-кабинеты, а также 3-ий в Европе Аквапарк, работающий на минеральной воде.
Подобные центры есть только в Баден-Бадене и Карловых Варах.

Санаторий предлагает восстановление после перенесенных заболеваний и лечение в период ремиссии хронических заболеваний. А именно: